Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc163A2AGD7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms