Protein–RNA interactions for Protein: A2AEP0

Obp1b, Odorant-binding protein 1b, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obp1bA2AEP0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Obp1bA2AEP0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Obp1bA2AEP0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Obp1bA2AEP0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms