Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyb561d1A2AE42 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms