Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm884A2A9H6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm884A2A9H6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms