Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87977A2A958 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87977A2A958 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87977A2A958 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87977A2A958 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87977A2A958 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C87977A2A958 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87977A2A958 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C87977A2A958 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms