Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Calcoco2A2A6M5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms