Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Akap17bA2A3V1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Akap17bA2A3V1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Akap17bA2A3V1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms