Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms