Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
4930469K13RikA0A286YDB2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms