Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms