Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms