Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms