Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Dnm2-203ENSMUST00000115404 3455 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm26911-201ENSMUST00000181770 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap25-203ENSMUST00000113637 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Zmiz2-202ENSMUST00000102914 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Itga9-202ENSMUST00000124360 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Gm20611-201ENSMUST00000177492 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Plekhb2-203ENSMUST00000156687 5176 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Stk36-202ENSMUST00000087186 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Rnf111-207ENSMUST00000215848 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Cnbd2-203ENSMUST00000109580 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm13914-201ENSMUST00000118202 991 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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