Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 St5-202ENSMUST00000079282 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms