Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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