Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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