Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Lig3-203ENSMUST00000092849 4560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Eif4e2-201ENSMUST00000050876 2869 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ms4a6c-201ENSMUST00000165310 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 4930571K23Rik-201ENSMUST00000166958 2153 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Upp2-203ENSMUST00000102755 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gp1ba-201ENSMUST00000055184 2710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 A3galt2-201ENSMUST00000030585 3390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms