Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Armcx5-201ENSMUST00000096321 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cdh8-205ENSMUST00000142475 3216 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm3912-202ENSMUST00000210164 643 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Siglech-203ENSMUST00000121492 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm44095-201ENSMUST00000204631 1931 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Arid3b-201ENSMUST00000004780 3785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm44815-201ENSMUST00000206812 1633 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Olfr1513-201ENSMUST00000089739 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs7b-201ENSMUST00000042281 1553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Slc5a1-201ENSMUST00000011178 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 R3hcc1l-201ENSMUST00000026188 4112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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