Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cdc6-201ENSMUST00000092706 4614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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