Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm45047-201ENSMUST00000207651 309 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm9946-201ENSMUST00000008011 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm25973-201ENSMUST00000083717 127 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm12269-201ENSMUST00000122273 717 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rps29P62274 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms