Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ccpg1-202ENSMUST00000085350 2969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm31135-201ENSMUST00000208460 1782 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm43511-201ENSMUST00000197084 2297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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