Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 CT010575.1-201ENSMUST00000220666 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm17090-201ENSMUST00000171768 490 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm20611-201ENSMUST00000177492 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Mir8113-201ENSMUST00000184956 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Drc3-203ENSMUST00000108722 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm4926-201ENSMUST00000132691 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Arhgap10-203ENSMUST00000210922 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm11513-201ENSMUST00000138855 751 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm12154-201ENSMUST00000145584 445 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms