Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CartptP56388 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CartptP56388 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms