Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm20463-201ENSMUST00000174756 366 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 AC123692.1-201ENSMUST00000227514 730 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rnf219-204ENSMUST00000228448 1056 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cbr1-201ENSMUST00000039659 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Scp2-ps2-201ENSMUST00000072166 478 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Lgals9-201ENSMUST00000073001 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ebf3-205ENSMUST00000209578 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 A530006G24Rik-201ENSMUST00000152542 1331 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 n-R5s2-201ENSMUST00000101968 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 n-R5s194-201ENSMUST00000104719 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rgs5-202ENSMUST00000152809 723 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm8379-201ENSMUST00000165448 1192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 n-R5s112-201ENSMUST00000178208 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 n-R5s125-201ENSMUST00000179377 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 n-R5s120-201ENSMUST00000180000 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm2907-201ENSMUST00000181256 1192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 AC125488.2-201ENSMUST00000218908 793 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 n-R5s33-201ENSMUST00000093713 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Olfr1283-203ENSMUST00000216637 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 AC164437.1-201ENSMUST00000227321 2308 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm26700-201ENSMUST00000181480 1957 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AC122858.2-201ENSMUST00000228571 1362 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm18859-201ENSMUST00000118792 825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm13864-201ENSMUST00000119745 785 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Fank1-202ENSMUST00000121560 475 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm13685-201ENSMUST00000122462 141 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 BC048671-202ENSMUST00000167550 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm37955-201ENSMUST00000195098 212 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Upp1-201ENSMUST00000020677 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rnf212b-201ENSMUST00000218311 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AC157772.1-201ENSMUST00000226266 365 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rpl7a-ps8-201ENSMUST00000094754 801 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm826-201ENSMUST00000099127 637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ctla4-201ENSMUST00000027164 1933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pm20d1-201ENSMUST00000048660 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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