Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ckap2lQ7TS74 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms