Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Upp2-203ENSMUST00000102755 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxb4P10284 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms