Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Ick-204ENSMUST00000118869 2540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Zfp189-201ENSMUST00000042964 2835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Pcdhb12-201ENSMUST00000055495 3034 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Cnpy4-202ENSMUST00000110934 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 R3hcc1l-201ENSMUST00000026188 4112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm42765-202ENSMUST00000200017 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Kif28-203ENSMUST00000221136 3538 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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Gm20795J3QP49 Nell2-201ENSMUST00000075275 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Vps8-204ENSMUST00000117598 4935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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Gm20795J3QP49 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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Gm20795J3QP49 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
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Gm20795J3QP49 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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Gm20795J3QP49 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 CT010486.2-201ENSMUST00000224003 2714 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Cabyr-206ENSMUST00000186263 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm5281-201ENSMUST00000197542 2134 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Lrrc14b-201ENSMUST00000022064 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm4926-201ENSMUST00000132691 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Limk2-202ENSMUST00000101640 3711 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm31024-201ENSMUST00000207600 2353 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Snx6-204ENSMUST00000218934 1441 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Gm37459-201ENSMUST00000192259 2840 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20795J3QP49 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20795J3QP49 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20795J3QP49 Gm45705-201ENSMUST00000211831 2134 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20795J3QP49 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20795J3QP49 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
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