Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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