Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ClgnP52194 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms