Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atf6F6VAN0 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atf6F6VAN0 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atf6F6VAN0 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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