Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cep63-211ENSMUST00000216281 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Csl-201ENSMUST00000056085 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Polr1e-201ENSMUST00000029999 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm14147-202ENSMUST00000178211 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm4405-201ENSMUST00000106038 982 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm12019-201ENSMUST00000121258 532 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Taar7c-ps-201ENSMUST00000122123 1055 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Myl12a-202ENSMUST00000123686 804 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-62-201ENSMUST00000177795 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rcan2-203ENSMUST00000177857 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm5550-201ENSMUST00000198658 1076 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm32858-201ENSMUST00000205246 585 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 9330159N22Rik-201ENSMUST00000221530 1031 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 1810011H11Rik-202ENSMUST00000227060 496 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Olfr1513-201ENSMUST00000089739 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Esd-201ENSMUST00000022573 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm14504-201ENSMUST00000119391 1497 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 9530056K15Rik-201ENSMUST00000061947 2315 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Magea7-ps-201ENSMUST00000117727 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm11546-201ENSMUST00000120297 354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm12726-201ENSMUST00000121621 601 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm8091-201ENSMUST00000150506 886 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ggta1-209ENSMUST00000164889 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ly6c1-205ENSMUST00000187347 522 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm29718-201ENSMUST00000193396 477 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ctsw-201ENSMUST00000025844 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Defa21-201ENSMUST00000076754 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm4795-201ENSMUST00000095717 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Defa22-201ENSMUST00000098897 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tox-201ENSMUST00000039987 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Mipol1-205ENSMUST00000145003 1424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Efcab12-203ENSMUST00000184428 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm1979-201ENSMUST00000168875 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp1-203ENSMUST00000172901 1903 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm13914-201ENSMUST00000118202 991 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Olfr122-201ENSMUST00000119082 993 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Hmox2-203ENSMUST00000120232 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ccl19-203ENSMUST00000140546 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Mir378b-201ENSMUST00000175244 92 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm43049-201ENSMUST00000198099 462 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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