Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 AC123619.1-203ENSMUST00000225276 2757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ms4a6c-201ENSMUST00000165310 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Acox3-201ENSMUST00000068563 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm21276-201ENSMUST00000179666 2626 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Washc5-202ENSMUST00000227725 2618 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Nkd1-202ENSMUST00000169179 4081 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef10l-204ENSMUST00000105797 3507 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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