Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Otud1Q9CUB6 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Otud1Q9CUB6 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Otud1Q9CUB6 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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