Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms