Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm13623-201ENSMUST00000118359 625 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 4930573I07Rik-202ENSMUST00000199120 413 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Cryaa-206ENSMUST00000228716 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp54Q8BL06 4933400L20Rik-202ENSMUST00000211119 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp54Q8BL06 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp54Q8BL06 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp54Q8BL06 Gm15499-201ENSMUST00000141390 422 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp54Q8BL06 Gm15645-202ENSMUST00000183393 1299 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm8982-201ENSMUST00000184198 1295 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp54Q8BL06 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp54Q8BL06 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp54Q8BL06 Plscr5-201ENSMUST00000179751 1191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp54Q8BL06 E130114P18Rik-209ENSMUST00000186369 306 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Retnlg-201ENSMUST00000065666 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Calr3-202ENSMUST00000109974 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Rufy3-202ENSMUST00000196686 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm10113-201ENSMUST00000072437 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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