Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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