Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm16575-201ENSMUST00000162186 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 BC048671-202ENSMUST00000167550 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Sat2-201ENSMUST00000092969 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ap3m1-201ENSMUST00000022371 1770 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 n-R5s2-201ENSMUST00000101968 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 n-R5s194-201ENSMUST00000104719 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 n-R5s112-201ENSMUST00000178208 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 n-R5s125-201ENSMUST00000179377 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 n-R5s120-201ENSMUST00000180000 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm28115-201ENSMUST00000188985 360 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm43957-201ENSMUST00000203606 362 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 AC091683.2-201ENSMUST00000222996 1185 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 n-R5s33-201ENSMUST00000093713 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Defa22-201ENSMUST00000098897 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ces5a-201ENSMUST00000077816 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 G6pc-201ENSMUST00000019469 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm14666-201ENSMUST00000121121 843 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ear6-202ENSMUST00000169070 893 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Abracl-201ENSMUST00000020002 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Osbpl3-203ENSMUST00000114466 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm15942-201ENSMUST00000136305 810 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm39128-201ENSMUST00000208237 1094 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 4930473H19Rik-202ENSMUST00000222124 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ctla4-201ENSMUST00000027164 1933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Pla2g6-202ENSMUST00000166977 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Clstn3-202ENSMUST00000112523 3703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Mfap5-207ENSMUST00000148517 1506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Olfr1283-203ENSMUST00000216637 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm3176-201ENSMUST00000200920 1249 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Olfr1491-204ENSMUST00000216366 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm37521-201ENSMUST00000193177 2045 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms