Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CartptP56388 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CartptP56388 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms