Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms