Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm14083-201ENSMUST00000117873 620 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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