Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ccna1-201ENSMUST00000029368 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Slco4c1-201ENSMUST00000071985 4908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm28988-201ENSMUST00000191363 1897 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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