Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trub1Q8C0D0 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms