Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znrf3Q5SSZ7 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms