Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Atf6F6VAN0 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Atf6F6VAN0 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6F6VAN0 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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