Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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