Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms