Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ank3-237ENSMUST00000183074 4948 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atg16l1Q8C0J2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atg16l1Q8C0J2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atg16l1Q8C0J2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atg16l1Q8C0J2 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Cdc6-201ENSMUST00000092706 4614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Atg16l1Q8C0J2 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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