Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm2897-201ENSMUST00000166494 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm3411-201ENSMUST00000170104 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Pla2g5-202ENSMUST00000102511 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Lsm6-204ENSMUST00000146824 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm42777-201ENSMUST00000196026 3603 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Snx6-204ENSMUST00000218934 1441 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm36426-201ENSMUST00000222903 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms