Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Gm32849-201ENSMUST00000208696 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cux1P53564 Birc3-202ENSMUST00000115672 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Rgs6-201ENSMUST00000101234 1368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm8513-201ENSMUST00000182830 1003 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Olfr1229-201ENSMUST00000099788 1019 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm22987-201ENSMUST00000122757 246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Rit1-207ENSMUST00000172252 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm37065-202ENSMUST00000192000 568 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 1700008N11Rik-201ENSMUST00000209848 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm45440-201ENSMUST00000209826 1655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 CT572998.1-201ENSMUST00000219636 1557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Nos2-203ENSMUST00000214397 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm14264-201ENSMUST00000147141 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Rspo4os-201ENSMUST00000152229 1281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm22009-201ENSMUST00000158792 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Airn-204ENSMUST00000160932 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Rpl6-201ENSMUST00000031617 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 BB014433-203ENSMUST00000179941 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm7180-201ENSMUST00000121753 513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 1810019D21Rik-203ENSMUST00000145343 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Kcne3-204ENSMUST00000179842 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm18538-201ENSMUST00000204265 484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm45538-201ENSMUST00000210771 1061 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gm7125-201ENSMUST00000093430 273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Cyp19a1-201ENSMUST00000034811 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cux1P53564 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms