Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms